L'Università degli Studi di Foggia, istituita nel 1999, è articolata in 6 Facoltà: Agraria, Economia, Giurisprudenza, Lettere e Filosofia, Medicina e Chirurgia e Scienze della Formazione. Il polo universitario foggiano presenta un apparato di biblioteche, centri di formazione e laboratori che sostiene fortemente la didattica e la ricerca. L'Ateneo foggiano è strettamente collegato con le aziende del territorio e non, e presenta una fitta rete di servizi dedicati agli studenti sia dal punto di vista dell'orientamento sia a livello logistico.

Per l'anno accademico 2009/10 sono attivi ben 21 corsi di Laurea di primo livello: Scienze e Tecnologie Alimentari; Scienze e Tecnologie Agrarie; Viticoltura ed Enologia; Economia Aziendale; Economia e Gestione dei Servizi Turistici; Economia; Economia dello Sviluppo Territoriale; Consulente del Lavoro ed Esperto di Relazioni Industriali; Operatore Giuridico della Pubblica Amministrazione; Lettere; Beni Culturali; Scienze dell'Educazione e della Formazione; Scienze delle Attività Motorie e Sportive; Infermieristica; Ostetricia; Fisioterapia; Educazione Professionale; Logopedia; Dietistica; Tecniche di Laboratorio Biomedico; Tecniche di Radiologia Medica per Immagini e Radioterapia.

I corsi di Laurea magistrale sono: Scienze e Tecnologie Agrarie; Scienze e Tecnologie Alimentari; Scienze degli Alimenti e Nutrizione Umana; Giurisprudenza; Scienze e Tecniche delle Attività Motorie Preventive e Adattate; Medicina e Chirurgia; Odontoiatria e Protesi Dentaria; Finanza; Economia Aziendale; Marketing Management; Archeologia; Filologia, Letterature e Storia; Scienze Pedagogiche e della Progettazione Educativa.

La Laurea specialistica attiva per questo anno accademico è: Scienze Infermieristiche ed Ostetriche. Sul piano dell'Alta Formazione sono attivi numerosi master, 30 scuole di specializzazione, di cui 29 dell'Area Medica e una per le Professioni Legali che afferisce alla Facoltà di Giurisprudenza, oltre a molteplici dottorati di ricerca.